Suite à une seconde infraction au Code du Secret commise pour protéger Dudley et lui de Détraqueurs, Harry est convoqué à une audience disciplinaire au Ministère de la Magie le 12 Août à 9h dans "l'Ordre du Phénix". Il encourt un renvoi de Poudlard et la destruction de sa baguette.
Dans l'OdP, Harry fonde, sur une idée d'Hermione, l'Armée de Dumbledore qui va lui permettre d'enseigner à d'autres élèves comment se défendre contre les forces du mal. A la suite de la bagarre à la fin du match de Quidditch entre Gryffondor et Serpentard, Ombrage lui interdit de jouer au Quidditch et confisque son balai. Cette année là, il découvre aussi l'existence des Sombrals, qu'il peut enfin voir.
A la fin de la dernière réunion de l'AD avant Noël, Cho embrasse Harry. Harry finit par l'inviter à une sortie à Pré-au-Lard pour la St Valentin, mais le rendez-vous chez Mme Pieddodu tourne assez mal. Tout au long de l'année, Cho passe la moitié de son temps à pleurer, ce qui laisse Harry très confus.
Harry ressent parfois une douleur à sa cicatrice, quand il se trouve face à Voldemort lui-même (lorsque Quirrell le touche pendant l'affrontement final de EdS, ou quand il fait un rêve extrèmement réaliste au début de "la Coupe de Feu") ou lorsque celui-ci ressent une vive émotion. Ce lien avec Voldemort s'accroit avec les années. Dans l'OdP, ses douleurs à la cicatrice sont très fréquentes, et il fait même un rêve particulièrment réaliste: il se retrouve dans la peau du serpent qui attaque Arthur Weasley. Quand son esprit est détendu et le plus vulnérable (quand il dort par exemple) il partage les pensées et les émotions de Voldemort. C'est pour cela qu'il doit prendre des cours d'Occlumancie: pour empêcher Voldemort de le contrôler.
Harry prend donc régulièrement des cours d'Occlumancie avec Rogue dans l'OdP. Malheureusement, il ne parvient pas à maîtriser cet art complexe. Il ne parvient à repousser Rogue et lire dans ses souvenirs à une seule occasion. Lors de l'un de ses cours, Harry plonge dans la Pensine de Rogue pendant que celui-ci s'absente, et découvre son père et Sirius humiliant Rogue en public, et sa mère prenant la défense de Rogue. L'image qu'il avait de père en prend alors un sacré coup.
Lorsqu'il fait un rêve au cours duquel il voit Sirius torturé par Voldemort, il n'hésite pas une seule seconde et part pour le Département des Mystères le sauver, accompagné par ses amis. Il est forcé de réaliser son erreur quand il découvre que Sirius n'y était pas, et qu'il ne s'agissait que d'un stratagème pour que Harry saisisse la prophétie le concernant lui et Voldemort. Après la mort de Sirius, Harry part à la poursuite de Bellatrix pour se venger, et tente même le sortilège de Doloris sur elle, mais ne parvient pas à y mettre suffisamment d'intention pour qu'il soit efficace. Harry se sent ensuite responsable de la mort de Sirius.




